1978年3月，杨浚调国家科委工作，先后任副局长、局长和科委副主任之职。杨浚一如既往，联系群众，调查研究，善于思考，勇于创新，在加强国家科技宏观管理方面，作出多方面的贡献。

    为加速中国计算机事业的发展，在国家科委主任方毅的领导下，杨浚与阎沛霖等计算机专家一起进行了起步性的工作。一是建议大力开发微型计算机应用。1979年，经批准引进500台微型计算机，在科学计算，工业控制、管理，教学等方面，发挥了很好的作用，并为后来开发和形成长城系列微型计算机产业起了先导作用。二是在天津、香港等地举办了多次计算机专业培训班，使一批部、委领导干部提高了对推广应用计算机重要意义的认识，并培养了一批微型计算机应用开发技术骨干，还安排建设湖南、武汉、北京等地计算机专业人员的教学基地建设和筹办信息研究所、软件中心等。三是安排建设了一批地方的计算中心，对提高中国计算机应用水平起了重要作用。

    杨浚重视围绕对国家经济发展有重大影响的项目，组织科技攻关，并和引进技术相结合。在工业方面，他在方毅领导下，具体组织落实甘肃金川、四川攀枝花、内蒙古包头三大共生矿综合利用，三峡工程建设准备，石油化工综合利用，煤气化液化，低温核供热堆，新能源，万门程控交换系统，中同轴4380路载波，1800路微波及光纤光缆通信系统等重大科技攻关工作。在农业方面，组织了山区、滩涂综合开发利用，三江平原开发，鄱阳湖开发等重大科技攻关工作。1981年，根据国务院领导指示，杨浚与国家计委副主任林华共同组织炼油和化工专家，经过1年半的调查研究、分析论证、规划测算等工作，开展了常压渣油催化裂化、裂解气中碳五的分离及综合利用、塑料改性及应用、石油化工催化剂、丁烯氧化脱氢制丁二烯等23个科技攻关，并取得成果。

    杨浚十分重视推进农村科技进步，他是“星火计划”倡导者之一。1983年，他在主持山区开发工作会议时，明确提出了科技进山、开发山区和振兴山区的意见，指出：对山区的开发要投入少，产出多;对贫困地区的开发要变“输血”为“造血”;强调推广“适用”技术、“不起眼”技术(后称为“短、平、快”技术);培养大批土生土长的农村科技人才。他的这一思路，为后来提出“星火计划”作了前期准备。

    1985年，在中国农村经济体制改革和农村科技工作均取得明显进展的情况下，杨浚与国家科委主任宋健、副主任吴明瑜等共同提出了“星火计划”的宏伟设想，旨在把“科技星火”点燃中国广大农村，引导8亿农民依靠科技振兴农业和乡镇企业，推动农村发展和农民生活改善。“星火计划”得到中共中央和国务院的批准，在国家科委统一领导下，杨浚负责组织“星火计划”的实施。他提出要建设年产值1000万元以上的乡镇企业，建设年产值1亿元以上的乡镇;在国家“七五”计划期间，建立500个推广“星火计划”示范企业，培训100万名农村知识青年和管理人员，开发100套实用技术装备;创造推广一批“星火计划”密储区、带;为实行“星火计划”开拓国内银行科技贷款和世界银行软、硬贷款。“星火计划”经过广泛实施，取得了显著的成绩，如“七五”期间的“星火计划”实施项目达2万多项，其中完成1.4万多项，累计创产值达300亿元。实施“星火计划”是一个创举，它年复一年、步步深入地在农村广泛实施，对引导科技与经济结合走出了一条新路，成为中国科技计划与国民经济计划的重要组成部分。

    杨浚还在制定和完善中国科技奖励制度方面做了很多工作。自1985年实施《中华人民共和国科学技术进步奖励条例》以来，他一直担任评审的组织领导工作，成效显著。1987年，在杨浚的建议下，国务院正式批准设立“国家星火奖”，他任评委会主任委员，经过几年的工作，“国家星火奖”已形成比较完善的体系。

    杨浚还与国家科委其他领导一起，会同国家计委和原国家经委，组织广大科技人员，制定了我国有关能源、材料、交通运输、通信、农业、信息等14个领域的技术政策要点，经国务院批准执行。

    杨浚在化学工业和科技管理领域中工作数十年，他远见卓识，辩证思维，精益求精，百折不挠，体现了中国化工专家的风范和作风，为青年一代树立了良好榜样。